Die Dokumentation "Expedition in die Tiefsee" schildert ein wissenschaftliches Abenteuer. Das mit Spitzentechnologie ausgestattete Forschungsschiff Western Flyer nimmt Kurs auf die Gewässer vor der kalifornischen Küste, um dort Walkadaver in 2.000 Meter Tiefe zu untersuchen. Chef der Expedition ist Craig Smith, ein Forscher der Universität von Hawaii. Vor 20 Jahren stellte er die These auf, die Kadaver der riesigen Meeressäugetiere müssten sich auf das ökologische Gleichgewicht des Tiefseegrabens auswirken, da bis dorthin normalerweise kaum Nahrung vordringt. Seine Entdeckungen haben diese Vermutung bestätigt und weitere Geheimnisse des Lebens in den Tiefen der Meere gelüftet.