Instrumente des Schreckens zeichnet den Anthrax-Anschlag nach, der 2001, wenige Wochen nach dem 11. September, die USA in Atem hielt. Die Dokumentation untersucht darüber hinaus verschiedene biologische Waffen auf deren Wirkungsweise und geht der Frage nach, wie sich die internationale Gemeinschaft vor solchen Gefahren schützen kann.Experten sind der Überzeugung, dass es keine Frage sei, ob biologische Waffen zum Einsatz kämen, sondern wann.